Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms