Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	CNS1	YBR155W	1158 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	TFA1	YKL028W	1449 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	IOC4	YMR044W	1428 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	PEP7	YDR323C	1548 nt		4.1	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YFT2	YDR319C	825 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	PEX21	YGR239C	867 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	RPC17	YJL011C	486 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YKL177W	YKL177W	339 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YLL047W	YLL047W	384 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	NIT3	YLR351C	876 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YBL094C	YBL094C	333 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	UTP23	YOR004W	765 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	YPR071W	YPR071W	636 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	STP22	YCL008C	1158 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	SRO9	YCL037C	1305 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	UGA3	YDL170W	1587 nt		4.09	□□□□□ -1.75
DSL1	P53847	RTK1	YDL025C	1863 nt		4.09	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	APL4	YPR029C	2499 nt		4.09	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	SYF1	YDR416W	2580 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YDR161W	YDR161W	1164 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	EBP2	YKL172W	1284 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	KAR5	YMR065W	1515 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	SUI1	YNL244C	327 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	WRS1	YOL097C	1299 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YOL166C	YOL166C	339 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	TMA16	YOR252W	537 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	FSH3	YOR280C	801 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	SCD6	YPR129W	1050 nt		4.08	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YMR1	YJR110W	2067 nt		4.07	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	NUP159	YIL115C	4383 nt		4.07	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YCR050C	YCR050C	309 nt		4.07	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	PCL2	YDL127W	927 nt		4.07	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YGR149W	YGR149W	1299 nt		4.07	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	PDX1	YGR193C	1233 nt		4.07	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	ARX1	YDR101C	1782 nt		4.07	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	MYO3	YKL129C	3819 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	DDI2	YFL061W	678 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	MRP4	YHL004W	1185 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	LAC1	YKL008C	1257 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	IDP2	YLR174W	1239 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YLR428C	YLR428C	345 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	ARG80	YMR042W	534 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	DDI3	YNL335W	678 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	VAM3	YOR106W	852 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	SSP2	YOR242C	1116 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	FYV5	YCL058C	459 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	BRE4	YDL231C	3378 nt		4.06	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	NAM9	YNL137C	1461 nt		4.05	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	PHM6	YDR281C	315 nt		4.05	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	SLX8	YER116C	825 nt		4.05	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	MRPS35	YGR165W	1038 nt		4.05	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	LDB18	YLL049W	540 nt		4.05	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	IAH1	YOR126C	717 nt		4.05	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	MCM7	YBR202W	2538 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	RRI1	YDL216C	1323 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	JAC1	YGL018C	555 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YHR022C	YHR022C	771 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	HIS6	YIL020C	786 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	GCD7	YLR291C	1146 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	CTL1	YMR180C	963 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	DSC2	YOL073C	969 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	ECM23	YPL021W	564 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	ALO1	YML086C	1581 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	AIM21	YIR003W	2040 nt		4.04	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	GEM1	YAL048C	1989 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	RKM3	YBR030W	1659 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	REB1	YBR049C	2433 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	MET17	YLR303W	1335 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	IMP3	YHR148W	552 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YJR056C	YJR056C	711 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YAE1	YJR067C	426 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	RPL14A	YKL006W	417 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	YBL036C	YBL036C	774 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	TEX1	YNL253W	1269 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	BAG7	YOR134W	1230 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	UBS1	YBR165W	834 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	EFM2	YBR271W	1260 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	GRX1	YCL035C	333 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	MIH1	YMR036C	1665 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	GCR1	YPL075W	2358 nt		4.03	□□□□□ -1.76
DSL1	P53847	HCA4	YJL033W	2313 nt		4.03	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YMR111C	YMR111C	1389 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	FLO10	YKR102W	3510 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PTA1	YAL043C	2358 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PUF2	YPR042C	3228 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YDR290W	YDR290W	330 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	OKP1	YGR179C	1221 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	SEC65	YML105C	822 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	ELA1	YNL230C	1140 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	PCL1	YNL289W	840 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	VPS68	YOL129W	555 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	snR17a	snR17a	333 nt		4.02	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	SPR6	YER115C	576 nt		4.01	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	KEG1	YFR042W	603 nt		4.01	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	YHR112C	YHR112C	1137 nt		4.01	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	AAH1	YNL141W	1044 nt		4.01	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	ATG8	YBL078C	354 nt		4.01	□□□□□ -1.77
DSL1	P53847	SNF8	YPL002C	702 nt		4.01	□□□□□ -1.77

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