Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNT2	P53127	EPL1	YFL024C	2499 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	NIS1	YNL078W	1224 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	NAB6	YML117W	3405 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	HER2	YMR293C	1395 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	YJR030C	YJR030C	2238 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	NUS1	YDL193W	1128 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	PNG1	YPL096W	1092 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	FAA2	YER015W	2235 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	IMD4	YML056C	1575 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	YDL176W	YDL176W	2127 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	BCH1	YMR237W	2175 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	CBP3	YPL215W	1008 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	SYF1	YDR416W	2580 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	FRE8	YLR047C	2061 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	CUE3	YGL110C	1875 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	GYP6	YJL044C	1377 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	YOR022C	YOR022C	2148 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	ESF1	YDR365C	1887 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	CAF120	YNL278W	3183 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	TMA10	YLR327C	261 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	GPI18	YBR004C	1302 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	SPT6	YGR116W	4356 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	KRS1	YDR037W	1776 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SNT2	P53127	RPS16B	YDL083C	432 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	TAF1	YGR274C	3201 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SAP155	YFR040W	3009 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	DPB2	YPR175W	2070 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	DOG1	YHR044C	741 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	FMP33	YJL161W	543 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SLD2	YKL108W	1362 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	FMP30	YPL103C	1407 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	INO80	YGL150C	4470 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	STV1	YMR054W	2673 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	PEA2	YER149C	1263 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SEN1	YLR430W	6696 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SEC27	YGL137W	2670 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	CDC14	YFR028C	1656 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	PAU23	YLR037C	375 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	NIT3	YLR351C	876 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SHH3	YMR118C	591 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	NUP133	YKR082W	3474 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	MUP3	YHL036W	1641 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	TLC1	TLC1	1301 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	RPL23B	YER117W	414 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SRP40	YKR092C	1221 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	YAR069C	YAR069C	294 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SAC1	YKL212W	1872 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	MPP10	YJR002W	1782 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SIS2	YKR072C	1689 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	YLR001C	YLR001C	2589 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	ZDS1	YMR273C	2748 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	CHS3	YBR023C	3498 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SED5	YLR026C	1023 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	YLR339C	YLR339C	552 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	DIB1	YPR082C	432 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SHG1	YBR258C	429 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	SSE2	YBR169C	2082 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	YER134C	YER134C	537 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SNT2	P53127	ARO10	YDR380W	1908 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	RPC37	YKR025W	849 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	PAM18	YLR008C	507 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	TRM44	YPL030W	1704 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	GAS4	YOL132W	1416 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	SIR1	YKR101W	1965 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	GPI14	YJR013W	1212 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	HST2	YPL015C	1074 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	NUP85	YJR042W	2235 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	ALG2	YGL065C	1512 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	VPS64	YDR200C	1815 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	VPS41	YDR080W	2979 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	YIL169C	YIL169C	2988 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	POL31	YJR006W	1464 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	IKI3	YLR384C	4050 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	YAK1	YJL141C	2424 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	YDL124W	YDL124W	939 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	MDM34	YGL219C	1380 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	MCM4	YPR019W	2802 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	YGR079W	YGR079W	1113 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	HEH2	YDR458C	1992 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	RRN11	YML043C	1524 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	TRS85	YDR108W	2097 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	NAM2	YLR382C	2685 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	RPS11A	YDR025W	471 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	CSM3	YMR048W	954 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	YDL180W	YDL180W	1644 nt		4.46	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.46	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	RPS21A	YKR057W	264 nt		4.46	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	FYV5	YCL058C	459 nt		4.46	□□□□□ -1.69
SNT2	P53127	ARP4	YJL081C	1470 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SNT2	P53127	GPI10	YGL142C	1851 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SNT2	P53127	YOR283W	YOR283W	693 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SNT2	P53127	BMS1	YPL217C	3552 nt		4.45	□□□□□ -1.7

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