Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THOP1P52888 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THOP1P52888 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THOP1P52888 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THOP1P52888 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THOP1P52888 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THOP1P52888 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THOP1P52888 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THOP1P52888 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THOP1P52888 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THOP1P52888 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THOP1P52888 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THOP1P52888 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THOP1P52888 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms