Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HK3P52790 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HK3P52790 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HK3P52790 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HK3P52790 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HK3P52790 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HK3P52790 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HK3P52790 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HK3P52790 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HK3P52790 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HK3P52790 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HK3P52790 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HK3P52790 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HK3P52790 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HK3P52790 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HK3P52790 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HK3P52790 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HK3P52790 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HK3P52790 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HK3P52790 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HK3P52790 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HK3P52790 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HK3P52790 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HK3P52790 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HK3P52790 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HK3P52790 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HK3P52790 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HK3P52790 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HK3P52790 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HK3P52790 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HK3P52790 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HK3P52790 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HK3P52790 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HK3P52790 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms