Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms