Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA3P51805 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms