Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFMP49411 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFMP49411 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFMP49411 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFMP49411 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFMP49411 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFMP49411 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFMP49411 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFMP49411 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFMP49411 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFMP49411 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFMP49411 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFMP49411 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFMP49411 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFMP49411 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFMP49411 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFMP49411 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFMP49411 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFMP49411 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFMP49411 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFMP49411 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFMP49411 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFMP49411 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFMP49411 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFMP49411 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFMP49411 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFMP49411 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFMP49411 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFMP49411 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFMP49411 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFMP49411 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFMP49411 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFMP49411 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFMP49411 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFMP49411 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFMP49411 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFMP49411 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFMP49411 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFMP49411 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFMP49411 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFMP49411 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFMP49411 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms