Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms