Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGRP47804 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGRP47804 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGRP47804 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGRP47804 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGRP47804 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGRP47804 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGRP47804 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGRP47804 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGRP47804 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGRP47804 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGRP47804 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGRP47804 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGRP47804 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGRP47804 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGRP47804 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGRP47804 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGRP47804 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGRP47804 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGRP47804 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGRP47804 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGRP47804 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGRP47804 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGRP47804 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGRP47804 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGRP47804 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGRP47804 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGRP47804 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGRP47804 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGRP47804 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms