Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL27AP46776 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL27AP46776 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms