Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFRSF4P43489 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF4P43489 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms