Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA1P43355 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms