Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPD2P43304 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPD2P43304 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPD2P43304 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPD2P43304 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPD2P43304 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPD2P43304 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPD2P43304 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPD2P43304 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPD2P43304 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPD2P43304 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPD2P43304 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPD2P43304 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms