Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP2P42575 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP2P42575 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP2P42575 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP2P42575 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP2P42575 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP2P42575 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP2P42575 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP2P42575 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP2P42575 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms