Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms