Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL1P40616 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL1P40616 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL1P40616 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms