Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PBX2P40425 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PBX2P40425 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX2P40425 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX2P40425 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX2P40425 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX2P40425 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX2P40425 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX2P40425 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX2P40425 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX2P40425 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX2P40425 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX2P40425 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX2P40425 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX2P40425 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX2P40425 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX2P40425 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX2P40425 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX2P40425 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX2P40425 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX2P40425 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX2P40425 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX2P40425 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX2P40425 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX2P40425 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX2P40425 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX2P40425 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX2P40425 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX2P40425 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX2P40425 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX2P40425 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX2P40425 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX2P40425 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX2P40425 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX2P40425 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX2P40425 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX2P40425 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX2P40425 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX2P40425 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX2P40425 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX2P40425 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX2P40425 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms