Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 AIM21YIR003W 2040 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YBR225WYBR225W 2703 nt3.59□□□□□ -1.83
DDI1P40087 CTR86YCR054C 1692 nt3.59□□□□□ -1.83
DDI1P40087 GZF3YJL110C 1656 nt3.59□□□□□ -1.83
DDI1P40087 APP1YNL094W 1764 nt3.59□□□□□ -1.83
DDI1P40087 COX18YGR062C 951 nt3.59□□□□□ -1.83
DDI1P40087 RRP36YOR287C 903 nt3.59□□□□□ -1.83
DDI1P40087 CKS1YBR135W 453 nt3.59□□□□□ -1.83
DDI1P40087 APE2YKL157W 2859 nt3.59□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SMP3YOR149C 1551 nt3.59□□□□□ -1.84
DDI1P40087 HEF3YNL014W 3135 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 RTS1YOR014W 2274 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SIP1YDR422C 2448 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 HSP30YCR021C 999 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YCR101CYCR101C 549 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 MAF1YDR005C 1188 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 TAF10YDR167W 621 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 PHO92YDR374C 921 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 BUR6YER159C 429 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SPT4YGR063C 309 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YHL026CYHL026C 948 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 PAM18YLR008C 507 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 PER33YLR064W 822 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YIM2YMR151W 438 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YPR022CYPR022C 3402 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 CTF18YMR078C 2226 nt3.58□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SPS2YDR522C 1509 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YGL074CYGL074C 327 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 COS12YGL263W 1143 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YGR139WYGR139W 339 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 MYO3YKL129C 3819 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 HTA2YBL003C 399 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 CPR3YML078W 549 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SLX1YBR228W 915 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 PRP22YER013W 3438 nt3.57□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YLR352WYLR352W 2424 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YRM1YOR172W 2361 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 HPR1YDR138W 2259 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YJR030CYJR030C 2238 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SSM4YIL030C 3960 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 DAN4YJR151C 3486 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 DIT2YDR402C 1470 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SOD1YJR104C 465 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 TTI2YJR136C 1266 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 DCS1YLR270W 1053 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YLR326WYLR326W 723 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 PEX12YMR026C 1200 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 IST1YNL265C 897 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 MVD1YNR043W 1191 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 GEM1YAL048C 1989 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 RTK1YDL025C 1863 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 LYP1YNL268W 1836 nt3.56□□□□□ -1.84
DDI1P40087 ARO9YHR137W 1542 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 OSH3YHR073W 2991 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 PUS9YDL036C 1389 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 PUB1YNL016W 1362 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 GDH2YDL215C 3279 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 MRPL11YDL202W 750 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 RSM25YIL093C 795 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YML053CYML053C 639 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 ERD2YBL040C 660 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 RRN9YMR270C 1098 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YPS7YDR349C 1791 nt3.55□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.54□□□□□ -1.84
DDI1P40087 BUD25YER014C-A 462 nt3.54□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YGR051CYGR051C 324 nt3.54□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.54□□□□□ -1.84
DDI1P40087 VPS21YOR089C 633 nt3.54□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SHE3YBR130C 1278 nt3.54□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YOL019WYOL019W 1656 nt3.54□□□□□ -1.84
DDI1P40087 GCD1YOR260W 1737 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SEC2YNL272C 2280 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YCL075WYCL075W 441 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 MAG1YER142C 891 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 YAR070CYAR070C 300 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 LTO1YNL260C 597 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 IDH2YOR136W 1110 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 NSP1YJL041W 2472 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 FLC1YPL221W 2382 nt3.53□□□□□ -1.84
DDI1P40087 SPA2YLL021W 4401 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 URA2YJL130C 6645 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 MET17YLR303W 1335 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 FAD1YDL045C 921 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YDR249CYDR249C 1122 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 BNA1YJR025C 534 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YJR038CYJR038C 363 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 TSR1YDL060W 2367 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 URC2YDR520C 2319 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 YEH2YLR020C 1617 nt3.52□□□□□ -1.85
DDI1P40087 TYR1YBR166C 1359 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 SPB4YFL002C 1821 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 FOX2YKR009C 2703 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 TAF6YGL112C 1551 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 RPB7YDR404C 516 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 FMP10YER182W 735 nt3.51□□□□□ -1.85
DDI1P40087 AUR1YKL004W 1206 nt3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.2 ms