Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms