Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	ENT3	YJR125C	1227 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YLR124W	YLR124W	345 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	RRP36	YOR287C	903 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	snR17a	snR17a	333 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	BOI2	YER114C	3123 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	SPT10	YJL127C	1923 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YCR050C	YCR050C	309 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	MAF1	YDR005C	1188 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	VMA22	YHR060W	546 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	SPC42	YKL042W	1092 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YLL017W	YLL017W	312 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	RAD33	YML011C	534 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YML053C	YML053C	639 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	TIR2	YOR010C	756 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YLR345W	YLR345W	1530 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YOL019W	YOL019W	1656 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	PMT6	YGR199W	2280 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	MIG3	YER028C	1185 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	IGO2	YHR132W-A	396 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YIL152W	YIL152W	708 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	REH1	YLR387C	1299 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YOR338W	YOR338W	1092 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YBR134W	YBR134W	402 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	NGL3	YML118W	1518 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	HST1	YOL068C	1512 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	VAC17	YCL063W	1272 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	DPB4	YDR121W	591 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	RPA14	YDR156W	414 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	PCL6	YER059W	1263 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	SPO74	YGL170C	1242 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	TMA19	YKL056C	504 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	ASI2	YNL159C	870 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	TIP41	YPR040W	1071 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	YDR132C	YDR132C	1488 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.15	□□□□□ -1.9
SHE2	P36068	GPI1	YGR216C	1830 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YER085C	YER085C	522 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YHR173C	YHR173C	339 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	UTP11	YKL099C	753 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YNL181W	YNL181W	1224 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	GLO4	YOR040W	858 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	FKH1	YIL131C	1455 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	ROK1	YGL171W	1695 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	NOP6	YDL213C	678 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	PSF1	YDR013W	627 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YGR126W	YGR126W	693 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	NAT3	YPR131C	588 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	ARR1	YPR199C	885 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YDR444W	YDR444W	2064 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	SOF1	YLL011W	1470 nt		3.14	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	STT4	YLR305C	5703 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	SPT3	YDR392W	1014 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	PUG1	YER185W	912 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	DSD1	YGL196W	1287 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	COX19	YLL018C-A	297 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	VTA1	YLR181C	993 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	FOL3	YMR113W	1284 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	GIS2	YNL255C	462 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	MVD1	YNR043W	1191 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	FDH2	YPL275W	711 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	SPN1	YPR133C	1233 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	POL1	YNL102W	4407 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	THR4	YCR053W	1545 nt		3.13	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	MRPL7	YDR237W	879 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	MSW1	YDR268W	1140 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	RSM25	YIL093C	795 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	MRP8	YKL142W	660 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YLR049C	YLR049C	1287 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	FLD1	YLR404W	858 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	DHH1	YDL160C	1521 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	DEG1	YFL001W	1329 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.12	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	GLO3	YER122C	1482 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	TAF10	YDR167W	621 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	SKI8	YGL213C	1194 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	YBL010C	YBL010C	843 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	IST1	YNL265C	897 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SHE2	P36068	KAP95	YLR347C	2586 nt		3.11	□□□□□ -1.91

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