Protein–RNA interactions for Protein: P35995

YKL222C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YKL222C, yeastyeast

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL222CP35995 MOT2YER068W 1764 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 RFA1YAR007C 1866 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 RGP1YDR137W 1992 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 EFG1YGR271C-A 702 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 GIC1YHR061C 945 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 RPS4BYHR203C 786 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 RPS4AYJR145C 786 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YBL077WYBL077W 432 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 ZPS1YOL154W 750 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 BSD2YBR290W 966 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YMR102CYMR102C 2505 nt5.5□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 OCT1YKL134C 2319 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 PHO12YHR215W 1404 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 PHO11YAR071W 1404 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YCR001WYCR001W 315 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 CPR1YDR155C 489 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YGR015CYGR015C 987 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 HRT3YLR097C 1035 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 CSH1YBR161W 1131 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 CLG1YGL215W 1359 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 CBF5YLR175W 1452 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 APC4YDR118W 1959 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 SAP4YGL229C 2457 nt5.49□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 HXT14YNL318C 1623 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 CLN2YPL256C 1638 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 CPS1YJL172W 1731 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 RAT1YOR048C 3021 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 ITT1YML068W 1395 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 LAP3YNL239W 1365 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YDL012CYDL012C 324 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 CNL1YDR357C 369 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 RSM28YDR494W 1086 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YER084W-AYER084W-A 513 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YGR042WYGR042W 816 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YHR173CYHR173C 339 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 AIM19YIL087C 474 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 GPN3YLR243W 819 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YNL013CYNL013C 378 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YNL146WYNL146W 303 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 DUG3YNL191W 1074 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YNR061CYNR061C 660 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 ELP2YGR200C 2367 nt5.48□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 ASF2YDL197C 1578 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YCR023CYCR023C 1836 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 snR83snR83 306 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 DBP8YHR169W 1296 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 THI11YJR156C 1023 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YOR379CYOR379C 339 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YBR051WYBR051W 351 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 ECM33YBR078W 1290 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 ARO4YBR249C 1113 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 PUS1YPL212C 1635 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 GGA1YDR358W 1674 nt5.47□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 YHL012WYHL012W 1482 nt5.46□□□□□ -1.53
YKL222CP35995 MEF2YJL102W 2460 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 YCR085WYCR085W 354 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 ATP16YDL004W 483 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 PPH3YDR075W 927 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 FOL2YGR267C 732 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 SNX4YJL036W 1272 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 YMR085WYMR085W 1299 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 SWM2YNR004W 441 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 ATP19YOL077W-A 207 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 FRE3YOR381W 2136 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 YPL114WYPL114W 420 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 ADY3YDL239C 2373 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 GLT1YDL171C 6438 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 APM2YHL019C 1818 nt5.46□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 CIK1YMR198W 1785 nt5.45□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 CTS1YLR286C 1689 nt5.45□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 SNL1YIL016W 480 nt5.45□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt5.45□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 DNF2YDR093W 4839 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 snR63snR63 255 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 TMA17YDL110C 453 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 COS4YFL062W 1140 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 LIN1YHR156C 1023 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 YIL152WYIL152W 708 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 RFA3YJL173C 369 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 MNN11YJL183W 1269 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 MTW1YAL034W-A 870 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 DID4YKL002W 699 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 NFU1YKL040C 771 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 UTP30YKR060W 825 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 COS3YML132W 1140 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 YIM1YMR152W 1098 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 SIA1YOR137C 1869 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 MFM1YPL060W 1242 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 HUT1YPL244C 1020 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 COS2YBR302C 1140 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 ALG6YOR002W 1635 nt5.44□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 KCC4YCL024W 3114 nt5.43□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt5.43□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 TLG1YDR468C 675 nt5.43□□□□□ -1.54
YKL222CP35995 EMC4YGL231C 573 nt5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87 ms