Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB2P35606 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB2P35606 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB2P35606 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB2P35606 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB2P35606 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB2P35606 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB2P35606 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPB2P35606 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB2P35606 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB2P35606 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB2P35606 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB2P35606 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB2P35606 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB2P35606 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB2P35606 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB2P35606 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB2P35606 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB2P35606 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPB2P35606 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPB2P35606 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPB2P35606 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPB2P35606 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms