Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA4P35212 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA4P35212 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA4P35212 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA4P35212 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA4P35212 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA4P35212 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA4P35212 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA4P35212 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA4P35212 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA4P35212 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA4P35212 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA4P35212 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA4P35212 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA4P35212 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA4P35212 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA4P35212 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA4P35212 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA4P35212 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA4P35212 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA4P35212 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA4P35212 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA4P35212 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA4P35212 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA4P35212 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA4P35212 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA4P35212 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA4P35212 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA4P35212 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms