Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2C19P33261 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms