Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms