Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR1P32246 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR1P32246 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR1P32246 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR1P32246 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR1P32246 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR1P32246 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR1P32246 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR1P32246 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR1P32246 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR1P32246 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR1P32246 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR1P32246 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR1P32246 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR1P32246 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR1P32246 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR1P32246 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR1P32246 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR1P32246 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR1P32246 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR1P32246 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR1P32246 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR1P32246 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR1P32246 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR1P32246 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR1P32246 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR1P32246 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR1P32246 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR1P32246 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms