Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TSPOP30536 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TSPOP30536 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPOP30536 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPOP30536 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPOP30536 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPOP30536 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPOP30536 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms