Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP1P29466 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP1P29466 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP1P29466 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP1P29466 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP1P29466 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP1P29466 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP1P29466 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP1P29466 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP1P29466 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP1P29466 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP1P29466 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms