Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMLP26374 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMLP26374 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMLP26374 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMLP26374 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMLP26374 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMLP26374 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMLP26374 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHMLP26374 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMLP26374 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMLP26374 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMLP26374 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMLP26374 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMLP26374 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms