Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMA1P25786 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA1P25786 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms