Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM3P25205 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM3P25205 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM3P25205 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM3P25205 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM3P25205 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM3P25205 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM3P25205 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCM3P25205 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCM3P25205 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM3P25205 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms