Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTAFRP25105 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms