Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms