Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCSHP23434 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCSHP23434 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCSHP23434 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCSHP23434 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCSHP23434 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCSHP23434 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSHP23434 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSHP23434 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSHP23434 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSHP23434 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSHP23434 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSHP23434 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCSHP23434 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSHP23434 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSHP23434 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSHP23434 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSHP23434 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCSHP23434 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCSHP23434 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCSHP23434 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms