Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms