Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PVALBP20472 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PVALBP20472 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PVALBP20472 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PVALBP20472 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PVALBP20472 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PVALBP20472 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PVALBP20472 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PVALBP20472 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PVALBP20472 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PVALBP20472 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PVALBP20472 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PVALBP20472 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PVALBP20472 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms