Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB5AP20339 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms