Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD33P20138 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD33P20138 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD33P20138 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD33P20138 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD33P20138 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD33P20138 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CD33P20138 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD33P20138 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD33P20138 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD33P20138 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD33P20138 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms