Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM21P19474 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms