Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC2P18074 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms