Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB8P17481 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB8P17481 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms