Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHRP16473 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHRP16473 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHRP16473 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHRP16473 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSHRP16473 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSHRP16473 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSHRP16473 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSHRP16473 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHRP16473 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHRP16473 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHRP16473 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHRP16473 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHRP16473 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHRP16473 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHRP16473 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHRP16473 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms