Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAG1P15918 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAG1P15918 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAG1P15918 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAG1P15918 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAG1P15918 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAG1P15918 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAG1P15918 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAG1P15918 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAG1P15918 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAG1P15918 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG1P15918 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAG1P15918 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG1P15918 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG1P15918 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG1P15918 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAG1P15918 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAG1P15918 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAG1P15918 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAG1P15918 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAG1P15918 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAG1P15918 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAG1P15918 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAG1P15918 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAG1P15918 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms