Protein–RNA interactions for Protein: P15421

GYPE, Glycophorin-E, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPEP15421 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GYPEP15421 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GYPEP15421 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GYPEP15421 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GYPEP15421 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms