Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCSHP14314 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms