Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCP1P13796 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCP1P13796 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCP1P13796 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCP1P13796 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCP1P13796 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCP1P13796 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCP1P13796 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LCP1P13796 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCP1P13796 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCP1P13796 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCP1P13796 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCP1P13796 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCP1P13796 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCP1P13796 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCP1P13796 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCP1P13796 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCP1P13796 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCP1P13796 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCP1P13796 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms