Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HARSP12081 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HARSP12081 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HARSP12081 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HARSP12081 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HARSP12081 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HARSP12081 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HARSP12081 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HARSP12081 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HARSP12081 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HARSP12081 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HARSP12081 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HARSP12081 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HARSP12081 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HARSP12081 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms