Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT3P12035 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT3P12035 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT3P12035 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT3P12035 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT3P12035 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms