Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODC1P11926 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODC1P11926 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ODC1P11926 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ODC1P11926 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODC1P11926 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODC1P11926 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODC1P11926 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ODC1P11926 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODC1P11926 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODC1P11926 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODC1P11926 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODC1P11926 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODC1P11926 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODC1P11926 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ODC1P11926 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms